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Recogida de datos relativos a la salud y al bienestar de los animales

El enfoque SIGMA para la recopilación de datos se desarrolló en el contexto del proyecto SIGMA (2018-2021) para mejorar la recopilación de datos de salud animal de los países europeos.

Proyecto SIGMA: una nueva forma de recopilar datos zoosanitarios

Antes de la introducción del enfoque SIGMA, la recopilación de datos zoosanitarios estaba impulsada por el único objetivo de responder a preguntas específicas recibidas por los distintos solicitantes, como la Comisión Europea y el Parlamento Europeo. Cada actividad de recogida de datos se llevaba a cabo una sola vez, para necesidades y fines específicos, y sin garantizar necesariamente la coherencia de los datos a lo largo del tiempo.

En los últimos años, la necesidad de realizar un seguimiento continuo de enfermedades importantes como la peste porcina africana y la gripe aviar se ha vuelto más rigurosa. El número de proveedores de datos ha aumentado, las solicitudes de presentación de datos se han hecho más frecuentes y la información solicitada es más detallada y sofisticada.

En este contexto, el proyecto SIGMA nació con el objetivo de:

  • establecer nuevas normas para la recogida de datos esenciales, como el tamaño de la población Comunidad de personas, animales o plantas de la misma especie. de animales domésticos;
  • aumentar la calidad y la comparabilidad de los datos recibidos entre los Estados miembros y a lo largo del tiempo;
  • pasar de la presentación manual de datos a un proceso automatizado;
  • reducir el tiempo necesario para recuperar datos actualizados que sean pertinentes para la evaluación del riesgo Ámbito especializado de las ciencias aplicadas que consiste en revisar datos y estudios científicos con el fin de evaluar los riesgos asociados a determinados peligros. Consta de cuatro etapas: identificación del peligro, caracterización del peligro, evaluación de la exposición y caracterización del riesgo..
  • facilitar a los Estados miembros instrumentos para elaborar automáticamente informes nacionales sobre salud y vigilancia de los animales en un entorno protegido ;
  • evitar la doble notificación a la EFSA y, posiblemente, a otros repositorios de datos.

El proyecto lo está llevando a cabo un consorcio encabezado por el Istituto Zooprofilattico Sperimentale (IZS) Abruzzo e Molise «G. Camorale» en colaboración con el Friedrich Loeffler Institut (FLI), el Instituto Veterinario Nacional Sueco (SVA), la Agencia Búlgara de Seguridad Alimentaria y el Instituto de Medicina Veterinaria y Zoología de la Universidad de Biología de Estonia.

Modelo de datos de la población animal

Datos principales:

  • diseñado para adaptarse a todas las especies Subdivisión del género, la especie es un grupo de organismos estrechamente relacionados y de apariencia similar; en el caso del Homo sapiens (el ser humano), la segunda parte del nombre (sapiens) representa a la especie. de animales domésticos de Europa, garantizando la integridad de los datos recogidos a lo largo del tiempo y entre distintos países;
  • el nivel de detalle es a nivel de explotación agropecuaria;
  • las normas se toman principalmente de la legislación sobre sanidad animal y, sólo cuando dichas normas no existen, de otra legislación pertinente o acordada por el grupo de trabajo de expertos SIGMA;
  • interoperable con los datos de los resultados de los ensayos almacenados en el Depósito de Datos Científicos de la EFSA.

Datos de laboratorio sobre el modelo de datos de pruebas de enfermedades animales

Datos principales:

  • se basa en las normas SSD2 de la EFSA;
  • adaptadas a las necesidades de la sanidad animal (por ejemplo, muestras «de origen animal»);
  • vinculada a los datos de la población animal mediante el número de identificación de la explotación agropecuaria;
  • cuando se combinan con los datos de la población animal, proporcionan información sobre:
    • el número de explotaciones agropecuarias incluidas en la muestra,
    • cuántos animales había en cada explotación,
    • cuántas de ellas fueron incluidas en la muestra,
    • cuál de ellos dio positivo...
    • ... a lo largo del tiempo;
  • incluye la información recopilada sobre otros posibles factores de riesgo (p. ej., alojamiento al aire libre o en interiores).

Tarjetas nacionales

Datos principales:

  • un sitio web de acceso abierto que ofrece una visión general e información sobre la titularidad de los datos en cada país europeo;
  • desarrollado y mantenido por la EFSA con la contribución de los puntos focales de la EFSA.

Informes sobre flujos de datos

La EFSA, con el apoyo del consorcio SIGMA y la contribución de los puntos focales, ha publicado una serie de informes técnicos que describen los flujos de datos nacionales, desde su generación hasta su almacenamiento en repositorios nacionales. Estos informes serán especialmente importantes para los objetivos establecidos en el proyecto SIGMA 2.0, cuyo objetivo es automatizar aún más el proceso de presentación de datos.

Herramienta cartográfica SIGMA EST

Datos principales:

  • aplicación web para la transformación automatizada de datos nacionales (independientemente de la lengua, del alfabeto o de las normas) en una base de datos estándar de la EFSA;
  • requiere una configuración (única) inicial, sin que sea necesario realizar un esfuerzo adicional para las siguientes traducciones (normalmente anuales);
  • el acceso se concede previa creación de credenciales.

Herramienta de validación SIGMA

Datos principales:

  • conjunto de mapas, cuadros y gráficos para una validación informada de los datos;
  • todos los productos pueden descargarse y utilizarse para otros fines (por ejemplo, actividades nacionales de presentación de informes)
  • desarrollado con la actual herramienta de inteligencia empresarial de la EFSA (MicroStrategy).

Preguntas y respuestas

1. ¿Qué es la recopilación de datos SIGMA?

SIGMA puede entenderse como un enfoque integrado de la recogida de datos, que ofrece un conjunto de herramientas para facilitar y acelerar el proceso. Solo las normas (es decir, el modelo de datos de población animal y el modelo de datos de laboratorio) son obligatorias. Por lo tanto, una «recopilación de datos SIGMA» es, en última instancia, la recopilación de datos siguiendo las normas SIGMA.

2. ¿Qué novedades presenta SIGMA?

La principal novedad introducida con SIGMA son sus normas, en particular el modelo de datos de población animal.

Anteriormente, la EFSA recopilaba datos sobre el ganado europeo con un nivel de detalle mucho menor, y la información recopilada no estaba centralizada en ningún lugar: solo los países de origen conservaban registros de las explotaciones de su territorio. Sin embargo, un buen conocimiento de la población de animales domésticos es crucial para evaluar adecuadamente el riesgo. Por ejemplo, no se puede calcular un parámetro epidemiológico básico como la prevalencia Porcentaje de una población que padece una enfermedad.* de una enfermedad si no se conoce la población.

Por este motivo, se decidió introducir un módulo específico para la recogida de datos sobre el ganado, a nivel de explotación. En última instancia, estos se combinarán con los datos de laboratorio de la EFSA para obtener una imagen completa. Al final del proceso, la EFSA podrá evaluar:

  • cuántas explotaciones agrícolas hay en una zona determinada
  • cuántas de ellas fueron sometidas a pruebas;
  • cuántos animales había en cada explotación;
  • cuántos animales fueron sometidos a pruebas;
  • cuántos animales sometidos a pruebas dieron positivo.

Con la información adicional recopilada (posibles factores de riesgo) y la información sobre toda la población, la EFSA podrá mejorar la precisión de las estimaciones de los parámetros epidemiológicos pertinentes.

* La prevalencia es la relación entre el número de animales (elegidos aleatoriamente) que dan positivo en la prueba y la población a la que pertenecen.

3. ¿Se ha validado el enfoque SIGMA?

Sí. En 2021, la recopilación de datos sobre la peste porcina africana se llevó a cabo utilizando el enfoque SIGMA. A pesar de la introducción de nuevos elementos (un nuevo conjunto completo de datos sobre agricultura doméstica, una nueva herramienta cartográfica), los datos se presentaron sin retrasos adicionales con respecto a años anteriores. Por lo tanto, se espera que, a partir de 2022, los datos se reciban en un plazo más breve, ya que la curva de aprendizaje ha alcanzado su punto límite.

4. ¿Cuáles son los retos?

Uno de los principales objetivos de SIGMA es seguir mejorando la experiencia de los proveedores de datos (Estados miembros) en el momento de presentar datos: el objetivo es lograr que el proceso sea tan fácil que, en cualquier momento, por ejemplo en el caso de una solicitud urgente de evaluación de riesgos, los proveedores de datos puedan enviar los datos necesarios en cuestión de días.

Un segundo objetivo importante es evitar cualquier doble notificación, en particular a la EFSA. Parece que el modelo de datos de la población animal de SIGMA permite recopilar datos con un nivel de detalle tal que pueden agregarse de cualquier manera posible, abordando también las necesidades de otras actividades, por ejemplo, el informe anual sobre zoonosis. El objetivo es pedir a los proveedores de datos que presenten sus datos una sola vez y en un formato único.

5. ¿Qué enfermedades animales son el objetivo de SIGMA?

En la actualidad, SIGMA cubre plenamente la recogida de datos sobre la peste porcina africana. La próxima enfermedad animal que abarcará SIGMA será la gripe aviar. En 2023, se llevará a cabo un proyecto piloto con Estados miembros voluntarios y, en marzo de 2024, tendrá lugar la primera presentación oficial de datos sobre la gripe aviar en SIGMA.

Otras enfermedades y poblaciones animales destinatarias relacionadas también estarán cubiertas por SIGMA, dando prioridad a las identificadas por el grupo de trabajo de la EFSA sobre el mandato de vigilancia con arreglo al concepto de «Una salud».

6. ¿Qué tipo de datos se recogen?

En términos generales, se recogen dos tipos de datos siguiendo el enfoque SIGMA:

  • Datos sobre las poblaciones de animales (como aves de corral, cerdos, bovinos): por ejemplo, ubicación y tamaño de la granja, especies animales, tipo de producción, etc.
  • datos sobre los resultados de las pruebas de laboratorio, incluido el identificador de la muestra, el identificador del establecimiento, el tipo de muestra, la fecha del muestreo y las pruebas, las pruebas de diagnóstico utilizadas y los resultados.

7. ¿Qué resolución de datos se requiere?

Los datos de población animal deben facilitarse a nivel del establecimiento (explotación o incluso lugares más definidos dentro de la explotación, si estos están registrados oficialmente a nivel nacional, por ejemplo, casas en el contexto de una explotación avícola). El modelo de datos puede registrar datos de geolocalización (latitud y longitud) y, en caso necesario, los proveedores de datos también pueden utilizar niveles más bajos de resolución.

Los datos de vigilancia (resultados de pruebas de laboratorio) deben facilitarse a nivel de resultados. En este caso, una variable de importancia crucial es el identificador del establecimiento, que debe notificarse cuando la muestra se recoge de un animal de granja. La identificación permite a la EFSA conectar los resultados de los ensayos con la información existente sobre la explotación de crianza del animal y, en última instancia, realizar una evaluación del riesgo y un análisis de los factores de riesgo adecuados. La no presentación de esta información limitará considerablemente las opciones analíticas de la EFSA para comprender mejor el comportamiento de la enfermedad y ayudar a los agricultores.

8. ¿Qué sucede con los datos de SIGMA una vez presentados a la EFSA?  

Todos los datos presentados a la EFSA, una vez validados por el Estado miembro, se almacenan en el Depósito de Datos Científicos de la EFSA. Posteriormente, la EFSA utiliza los datos para realizar evaluaciones del riesgo. En consonancia con los requisitos de transparencia pertinentes, los datos se publican de forma proactiva en el sitio «Knowledge Junction» de la EFSA (Zenodo).

9. ¿Cómo se protegen los datos una vez presentados a la EFSA?

Antes de publicar una evaluación del riesgo, nadie tiene acceso a los datos, excepto la EFSA. Tras su publicación, los datos se agregan y se ponen a disposición del público en el sitio «Knowledge Junction» (Zenodo) de la EFSA.

Todos los datos cubiertos por el RGPD (por ejemplo, identificación de explotaciones agrícolas, geolocalización, etc.) están protegidos y no se incluirán en el conjunto de datos publicado en el sitio «Knowledge Junction» de la EFSA.

Si los proveedores de datos consideran que algunos de sus datos compartidos con la EFSA son confidenciales, pueden solicitar que se mantenga su confidencialidad, siguiendo el procedimiento oficial.

10. ¿Cuáles son las condiciones para sacar partido del marco SIGMA?

Los requisitos mínimos son los siguientes:

  • los datos deben presentarse en formato digital;
  • si un proveedor de datos tiene intención de utilizar la herramienta de cartografía SIGMA EST, deberá realizar una inversión inicial única para la configuración.

¿Y ahora qué?

El proyecto SIGMA 2.0 (2022-2025) tiene cinco paquetes de trabajo (WP) diferentes:

  • WP01 — Generalización de SIGMA: las enfermedades animales adicionales y las poblaciones destinatarias relacionadas estarán cubiertas por el marco SIGMA.
  • WP02 — Ampliación de SIGMA: se diseñará un nuevo modelo de datos para la recogida de datos sobre el bienestar de los animales, interoperable con la población animal y los datos de los resultados de los ensayos de laboratorio.
  • WP03 – Mejora de SIGMA EST: se mejorará la herramienta de cartografía para mejorar la experiencia de los proveedores de datos en la presentación de datos a la EFSA, y se añadirán nuevas funciones (por ejemplo, una fase de validación antes de la presentación a la EFSA para comprobar el cumplimiento de las normas de trabajo).
  • WP04 — SIGMA M2M: el proceso de presentación de datos será totalmente automatizado (de máquina a máquina).
  • WP05 – SIGMA Caleidoscopio: una interfaz única para visualizar los datos presentados en el marco de SIGMA permitirá a los usuarios explorar, visualizar y crear informes basados en los datos disponibles presentados a la EFSA.