Colloque scientifique de l’EFSA N°20: Séquençage du génome entier d’agents pathogènes d’origine alimentaire pour la protection de la santé publique
90 scientifiques de renom, venus représenter des organisations internationales et européennes, ainsi que des autorités nationales de sécurité des aliments se sont réunis à Parme, en Italie, pour discuter de l'utilisation du séquençage du génome entier d'agents pathogènes d'origine alimentaire dans la protection de la santé publique. Le 20ème colloque scientifique de l'EFSA sur le séquençage du génome entier a eu lieu les 16 et 17 juin.
« Cette réunion a constitué une occasion unique pour des experts de renommée internationale de participer à des discussions sur des travaux scientifiques de pointe très prometteurs pour la santé publique », a déclaré Ernesto Liebana, chef faisant fonction de l’unité de l’EFSA en charge des contaminants et des dangers biologiques.
Les participants se sont penchés sur les méthodes disponibles, les stratégies d'analyse et d'interprétation des données, les défis liés à la gestion et la conservation des bases de données ou encore l'intégration du séquençage du génome entier dans le suivi, la surveillance et la préparation en cas d'épidémie. Les délégués ont souligné la nécessité pour les secteurs de l'alimentation et de la médecine humaine et vétérinaire de collaborer dans ce domaine.
L’expérience est encore limitée pour ce qui concerne l'utilisation de méthodes de séquençage dans les applications liées à la sécurité microbienne des aliments dans l'UE, mais cette technologie pourrait potentiellement constituer un outil très utile pour les évaluateurs et les gestionnaires des risques. « Cette réunion était opportune et bien ciblée. Elle guidera l'EFSA, l'ECDC et les autorités nationales de sécurité des aliments dans la construction d’une stratégie intégrée de séquençage du génome pour protéger la santé humaine contre les agents pathogènes d'origine alimentaire », a déclaré le président de la réunion, Marc Struelens.
Programme et notes d’information
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Briefing notes(147.79 KB)
Présentations
- Struelens (ECDC): Use of Whole Genome Sequencing (WGS) of food-borne pathogens for public health protection
- Allard (FDA): Establishing a Whole Genome Sequence-Based national network for the detection and traceback of foodborne pathogens
- Grant (Public Health England): Whole genome sequencing of foodborne pathogens: experiences from the reference laboratory
- Harmsen (University of Münster): One disrupting technology fits it all – towards standardized bacterial Whole Genome Sequencing for global surveillance
- Van Domselaar (Public Health Agency of Canada): Canada's IRIDA project for genomic epidemiology of food-borne pathogens
- Gerner-Smidt (CDC): Identification and characterization of foodborne pathogens by whole genome sequencing: a shift in paradigm
- Carrillo (Canadian Food Inspection Agency): Implementation of genomics technologies in regulatory food microbiology testing