Työmme ytimessä ovat EFSAn ulkopuolisten tieteellisten asiantuntijoiden tietämys, kokemus ja päätöksenteko.EFSAn tieteelliset lautakunnat vastaavat kaikista virastolle kuuluvista arvioinneista. EFSAn tieteelliset paneelit vastaavat suurimmasta osasta elintarviketurvallisuusviranomaisen arviointeja. Kukin lautakunta on omistautunut elintarvike- ja rehuketjun eri osa-alueille.
Tieteellisen komitean tehtävänä on tukea lautakuntien työskentelyä tieteidenvälisissä kysymyksissä. Sen tehtävänä on kehittää yhdenmukaistettuja riskinarviointimenetelmiä sellaisille aloille, joilla ei ole vielä määritetty EU:n laajuisia toimintatapoja.
Tiedekomitean ja lautakunnan jäsenyys uusitaan viiden vuoden välein perusteellisen ja avoimen valintamenettelyn jälkeen.
